Les principes du partenariat stratégique Afrique-UE sont établis par les gouvernements des États membres de l'UE, dans le cadre du Conseil de l'Union européenne.

Ce processus se déroule à plusieurs niveaux, des chefs de gouvernement ou des ministres des affaires étrangères qui se réunissent dans le cadre du Conseil «Affaires générales et relations extérieures» (CAGRE) aux groupes de travail spécialisés (comme, par exemple, le groupe «Afrique»), via le Comité des représentants permanents.

Rôles des autres parties

• La Commission européenne : elle pilote le partenariat dans tous les domaines politiques, qui vont bien au-delà des questions relatives au développement
• Le Parlement européen : il supervise la mise en œuvre du partenariat, en particulier par l'intermédiaire de ses commissions des affaires étrangères et du développement.

Les parlements nationaux et les autorités locales ont également leur mot à dire.

• La société civile : elle participe activement à la mise en œuvre et au suivi du partenariat. Des organismes non gouvernementaux ont mis en place un groupe de pilotage intérimaire, destiné à faciliter le dialogue et les échanges avec les institutions européennes et les acteurs de la société civile africaine.